Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PGBD1Q96JS3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms