Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LTV1Q96GA3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LTV1Q96GA3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms