Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC35A4Q96G79 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC35A4Q96G79 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC35A4Q96G79 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC35A4Q96G79 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC35A4Q96G79 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC35A4Q96G79 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC35A4Q96G79 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC35A4Q96G79 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC35A4Q96G79 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC35A4Q96G79 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC35A4Q96G79 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC35A4Q96G79 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC35A4Q96G79 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC35A4Q96G79 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC35A4Q96G79 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC35A4Q96G79 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC35A4Q96G79 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC35A4Q96G79 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC35A4Q96G79 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC35A4Q96G79 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC35A4Q96G79 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC35A4Q96G79 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC35A4Q96G79 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC35A4Q96G79 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC35A4Q96G79 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC35A4Q96G79 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC35A4Q96G79 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms