Protein–RNA interactions for Protein: Q92764

KRT35, Keratin, type I cuticular Ha5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT35Q92764 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRT35Q92764 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms