Protein–RNA interactions for Protein: Q92747

ARPC1A, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1AQ92747 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARPC1AQ92747 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms