Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX54Q8TDD1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms