Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HELBQ8NG08 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms