Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMIEQ8NEW7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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TMIEQ8NEW7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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TMIEQ8NEW7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
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TMIEQ8NEW7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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TMIEQ8NEW7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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TMIEQ8NEW7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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TMIEQ8NEW7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMIEQ8NEW7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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