Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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