Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HJURPQ8NCD3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HJURPQ8NCD3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms