Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ZIC4Q8N9L1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZIC4Q8N9L1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms