Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPUSD2Q8IZ73 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPUSD2Q8IZ73 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPUSD2Q8IZ73 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPUSD2Q8IZ73 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPUSD2Q8IZ73 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPUSD2Q8IZ73 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPUSD2Q8IZ73 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPUSD2Q8IZ73 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPUSD2Q8IZ73 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPUSD2Q8IZ73 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPUSD2Q8IZ73 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPUSD2Q8IZ73 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RPUSD2Q8IZ73 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPUSD2Q8IZ73 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RPUSD2Q8IZ73 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPUSD2Q8IZ73 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPUSD2Q8IZ73 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPUSD2Q8IZ73 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RPUSD2Q8IZ73 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPUSD2Q8IZ73 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPUSD2Q8IZ73 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPUSD2Q8IZ73 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPUSD2Q8IZ73 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPUSD2Q8IZ73 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPUSD2Q8IZ73 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPUSD2Q8IZ73 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPUSD2Q8IZ73 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RPUSD2Q8IZ73 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPUSD2Q8IZ73 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPUSD2Q8IZ73 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPUSD2Q8IZ73 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPUSD2Q8IZ73 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPUSD2Q8IZ73 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPUSD2Q8IZ73 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPUSD2Q8IZ73 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPUSD2Q8IZ73 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPUSD2Q8IZ73 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPUSD2Q8IZ73 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPUSD2Q8IZ73 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPUSD2Q8IZ73 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPUSD2Q8IZ73 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPUSD2Q8IZ73 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPUSD2Q8IZ73 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RPUSD2Q8IZ73 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms