Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVH2

FOXP4, Forkhead box protein P4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP4Q8IVH2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXP4Q8IVH2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXP4Q8IVH2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms