Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NME9Q86XW9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NME9Q86XW9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NME9Q86XW9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NME9Q86XW9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NME9Q86XW9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NME9Q86XW9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NME9Q86XW9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NME9Q86XW9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NME9Q86XW9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NME9Q86XW9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NME9Q86XW9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NME9Q86XW9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NME9Q86XW9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NME9Q86XW9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NME9Q86XW9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NME9Q86XW9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NME9Q86XW9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NME9Q86XW9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NME9Q86XW9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NME9Q86XW9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NME9Q86XW9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NME9Q86XW9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NME9Q86XW9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NME9Q86XW9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NME9Q86XW9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms