Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIBP1Q86W92 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms