Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms