Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSX7Q7RTT5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms