Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAPN12Q6ZSI9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms