Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4T0

C12orf54, Uncharacterized protein C12orf54, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf54Q6X4T0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C12orf54Q6X4T0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms