Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC171Q6TFL3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms