Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L2Q6R6M4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP17L2Q6R6M4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP17L2Q6R6M4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP17L2Q6R6M4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP17L2Q6R6M4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP17L2Q6R6M4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP17L2Q6R6M4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP17L2Q6R6M4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP17L2Q6R6M4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP17L2Q6R6M4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L2Q6R6M4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L2Q6R6M4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L2Q6R6M4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L2Q6R6M4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L2Q6R6M4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L2Q6R6M4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L2Q6R6M4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L2Q6R6M4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L2Q6R6M4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L2Q6R6M4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L2Q6R6M4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L2Q6R6M4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L2Q6R6M4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L2Q6R6M4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L2Q6R6M4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L2Q6R6M4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L2Q6R6M4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L2Q6R6M4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L2Q6R6M4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L2Q6R6M4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L2Q6R6M4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L2Q6R6M4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L2Q6R6M4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L2Q6R6M4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L2Q6R6M4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L2Q6R6M4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L2Q6R6M4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L2Q6R6M4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L2Q6R6M4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L2Q6R6M4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L2Q6R6M4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L2Q6R6M4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms