Protein–RNA interactions for Protein: Q6PL18

ATAD2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD2Q6PL18 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATAD2Q6PL18 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATAD2Q6PL18 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATAD2Q6PL18 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATAD2Q6PL18 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATAD2Q6PL18 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATAD2Q6PL18 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATAD2Q6PL18 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATAD2Q6PL18 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATAD2Q6PL18 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATAD2Q6PL18 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATAD2Q6PL18 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATAD2Q6PL18 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATAD2Q6PL18 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATAD2Q6PL18 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATAD2Q6PL18 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ATAD2Q6PL18 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATAD2Q6PL18 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATAD2Q6PL18 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATAD2Q6PL18 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATAD2Q6PL18 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATAD2Q6PL18 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATAD2Q6PL18 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATAD2Q6PL18 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATAD2Q6PL18 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATAD2Q6PL18 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATAD2Q6PL18 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATAD2Q6PL18 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATAD2Q6PL18 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATAD2Q6PL18 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATAD2Q6PL18 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATAD2Q6PL18 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATAD2Q6PL18 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATAD2Q6PL18 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATAD2Q6PL18 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATAD2Q6PL18 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ATAD2Q6PL18 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATAD2Q6PL18 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATAD2Q6PL18 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATAD2Q6PL18 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms