Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDC42EP5Q6NZY7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDC42EP5Q6NZY7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms