Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHEQ5VZ18 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms