Protein–RNA interactions for Protein: Q5TH69

ARFGEF3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF3Q5TH69 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFGEF3Q5TH69 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFGEF3Q5TH69 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGEF3Q5TH69 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms