Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LDLRAD1Q5T700 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms