Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC178Q5BJE1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC178Q5BJE1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms