Protein–RNA interactions for Protein: Q569G3

C5orf47, Uncharacterized protein C5orf47, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf47Q569G3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
C5orf47Q569G3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C5orf47Q569G3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms