Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CRY2Q49AN0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRY2Q49AN0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms