Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LONRF3Q496Y0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms