Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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CDO1Q16878 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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