Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HIST3H3Q16695 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HIST3H3Q16695 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms