Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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E2F4Q16254 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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E2F4Q16254 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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E2F4Q16254 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2F4Q16254 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms