Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NCOA1Q15788 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
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NCOA1Q15788 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
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NCOA1Q15788 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
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NCOA1Q15788 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
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NCOA1Q15788 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCOA1Q15788 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
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