Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SKIV2LQ15477 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKIV2LQ15477 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms