Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC23BQ15437 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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SEC23BQ15437 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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SEC23BQ15437 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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