Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDGFRLQ15198 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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