Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PCLAFQ15004 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCLAFQ15004 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms