Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFIXQ14938 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFIXQ14938 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
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