Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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SEMA3AQ14563 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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SEMA3AQ14563 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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SEMA3AQ14563 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SEMA3AQ14563 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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SEMA3AQ14563 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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SEMA3AQ14563 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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SEMA3AQ14563 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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SEMA3AQ14563 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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SEMA3AQ14563 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
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SEMA3AQ14563 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SEMA3AQ14563 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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