Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF4GQ14541 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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