Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms