Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF9Q13886 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLF9Q13886 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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