Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PICALMQ13492 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms