Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCIRG1Q13488 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
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