Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LSAMPQ13449 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LSAMPQ13449 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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