Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLAMF1Q13291 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms