Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DUSP4Q13115 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP4Q13115 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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