Protein–RNA interactions for Protein: Q13113

PDZK1IP1, PDZK1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1IP1Q13113 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZK1IP1Q13113 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms