Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL28Q13084 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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